कपालभाति का अभ्यास करने के लिए आप किसी भी ध्यान मुद्रा या आसान में बैठ सकते है, भले ही वे सुखासन, सिद्धासन, पद्मासन हो | आप को ध्यान देना है कि आपकी कमर सीधी होनी चाहिए | कपालभाति में यदि आप रीढ़ से नीचे की स्थिरता चाहते है, तो उस अनुसार पद्मासन ज्यादा प्रभावशाली आसन है, अन्यथा सिद्धासन भी उपयुक्त आसन है यदि कपालभाति और बाद में ध्यान का अभ्यास करना चाहते है